营改增后结算方如何处理不同纳税方式的差异

 营改增后控制价应该按增值税计税，但实际缴纳过程因为一般计税和简易计税的不同，以及税点的改变，造成了结算方难以计算，结算方应该如何解决这样的差异？

1：增值税税点从11%降低到10%又降低到9%，若某个工程时间囊括了这三个阶段，应该如何进行计算？

2：计价软件一般都按照一般计税方式计算计算，若施工方采用简易计税方式进行纳税，结算方应该如何调整？